Diferencias en Suplidos

Tengo un problema en Suplidos que os planteo. Mi empresa es intermediaria y cobro el suplido, lo que normalmente se produce es que se gestiona el suplido se paga y después se factura de manera que el importe sea cero, lo que a mi se me plantea es que es necesario cobrar el Suplido antes de su pago y en muchos casos el improte difiere, en estos casos que tratamiento debo dar al suplido? Si alguien me da una contestación lo agradecería